水生生物是栖息、生长在水域中重要的生物群落；是渔业生产的重要基础,渔业持续发展的重要保证；水生生物资源是人类社会生存发展的物质基础。随着国民经济的发展,生态环境的改变,导致了水生生物资源衰退,水域水生生物多样性指数下降,种质资源库作用被削弱,珍稀濒危物种数量增加,濒危程度加剧,一些重要的珍稀、濒危水生野生动物物种种群数量不断减少,有的甚至濒临灭绝。

新疆是我国水生生物多样性较丰富的地区之一,境内有大小河流320条,湖泊100多个和众多水库、沼泽,水域广阔,水源主要依靠高山冰川融雪和降水；水生生物资源和生物多样性较为丰富,具有物种特有程度高、孑遗物种数量大、生态系统类型复杂等特点,生物区系门类齐全,野生淡水鱼类50个种和亚种。同时也是我国冷水水域主要分布的区域之一,经调查新疆地区主要冷水性鱼类有30种,隶属于8目10科。区内气候条件差异显著,恶劣多变的自然条件导致新疆大部分区域生态脆弱,生态承载力相对低下,一旦破坏极难恢复